1985年，管理信息系成立；招收管理信息系统专业专科生。
1986年，招收管理信息系统专业本科班；数学教研室并入。
1991年，专业更名为经济信息管理专业；计算中心并入。
1993年，因成立基础部需要，数学教研室分出。
1994年，增设计算机应用(软件)专业。
1996年，系更名为计算机与信息工程系；原电子系计算机应用（硬件）专业并入。
2000年，获得管理科学与工程一级学科硕士学位授予权。
2001年，更名为计算机与信息工程学院。
2002年，获计算机应用技术硕士学位授予权；增设电子商务本科专业，管理科学与工程被列为省重点扶持学科。
2003年，信息管理与信息系统专业被列为省重点建设专业；在工商管理博士点设立企业管理信息化与决策支持系统研究方向；因学校成立现代教育技术中心，计算中心分出。
2004年，获计算机软件与理论硕士学位授予权；增设物流管理本科专业；管理科学与工程被列为省A类重点学科。
2005年，增设软件工程本科专业。
2007年，计算机科学与技术专业被列为浙江省重点建设专业。
2009年，增设物流工程领域工程硕士点；电子商务专业被列为省重点建设专业。
2010年，计算机科学与技术专业被列为国家特色专业；增设计算机技术领域工程硕士点；获批“电子商务与物流优化浙江省高等学校创新团队”；王勋入选浙江省“新世纪151人才工程”重点资助，魏贵义入选第一层次。
2011年，获批计算机科学与技术一级学科硕士学位授予权；增设信息安全本科专业；获批“电子商务技术浙江省重点创新团队”；浙江省电子商务与物流信息技术研究重点实验室。
2012年，计算机应用技术被列为浙江省重点学科；与政府、企业联合成立“杭州电子商务研究院”；计算机科学与技术、电子商务同时被列为浙江省优势专业。
2013年，作为牵头单位首次获国家科技支撑计划项目“影像文化与演艺事业的内容处理、展示和装配研发及示范”。
2014年，获批“电子商务与商务大数据技术省工程实验室”，“电子商务与现代物流浙江国际科技合作基地”，“现代商贸信息技术与工程省重点实验教学中心”。
2015年，“计算机科学与技术”获得省B类一流学科，“管理科学与工程”获得省A类一流学科。国家级平台“电子商务虚拟仿真中心”被教育部获批为国家级虚拟仿真实验教学中心。
2016年，《面向智慧商务的“工管融合、分层组合、多元结合”三创人才培养模式》获浙江省教学成果奖一等奖；获批“大数据统计”二级学科博士点。因学校成立管理工程与电子商务学院，信息管理与信息系统、电子商务、物流管理三个专业分出。
2017年，“计算机科学与技术”在教育部第四轮学科评估中获B-；获批“可视媒体大数据技术浙江省工程实验室”。
2018年，《基于“分层组合、工管融合、多元结合”的三创型智慧商务人才培养探索与实践》获国家教学成果二等奖；获批“城市复杂环境智能驾驶研究浙江省高校高水平创新团队” ；计算机科学与技术专业通过国家工程教育专业认证；
2019年，学院党委入选第二批全国党建工作标杆院系培育创建单位；“计算机科学与技术”获批国家一流建设专业；王勋教授作为首席科学家获批国家重点研发计划项目“混合现实环境下的观演空间支撑技术研发”。
2020年，“软件工程”获批国家一流建设专业。
2021年，计算机学科进入ESI全球排名前1%。
2022年，成功通过“全国党建工作标杆院系”建设验收；“信息安全”获批浙江省一流建设专业。
2023年，新一轮学科评估为B类。